- s -

• SailLight() : sortie.data.funcgroups.light.SailLight
• saveAll() : sortie.gui.DetailedOutputDeadTreeSetup , sortie.gui.DetailedOutputGridSetup , sortie.gui.DetailedOutputTreeSetup
• saveChartDataToFile() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest
• saveData() : sortie.gui.DetailedOutputDeadTreeSetup , sortie.gui.DetailedOutputTreeSetup , sortie.gui.GridValueEditor
• saveGrid() : sortie.gui.GridSetup
• savingShortOutputData() : sortie.data.funcgroups.OutputBehaviors
• ScheduledStormSetup() : sortie.gui.ScheduledStormSetup
• scroll() : sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest , sortie.gui.ManageTreeMap
• SeasonalWaterDeficit() : sortie.data.funcgroups.statechange.SeasonalWaterDeficit
• SeedPredationBehaviors() : sortie.data.funcgroups.SeedPredationBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.SeedPredationBehaviors
• SeedTableDataRequest() : sortie.datavisualizer.SeedTableDataRequest
• SelectionHarvest() : sortie.data.funcgroups.disturbance.SelectionHarvest
• SelfThinMort() : sortie.data.funcgroups.mortality.SelfThinMort
• sendMessage() : sortie.gui.MainWindow
• SenescenceMort() : sortie.data.funcgroups.mortality.SenescenceMort
• setAsciiTranslation() : sortie.fileops.TarArchive
• setBehaviorList() : sortie.gui.modelflowsetup.ModelFlowSetup
• setCanApplyTo() : sortie.data.funcgroups.Behavior
• setCellValues() : sortie.gui.harvepplant.EpisodicEventsMouseListener
• setChartFrameInfo() : sortie.datavisualizer.ModelInternalFrame
• setCode() : sortie.data.simpletypes.DataMember
• setCodeName() : sortie.data.simpletypes.DataMember
• setColor() : sortie.datavisualizer.XYSimpleCellRenderer
• setCount() : sortie.datavisualizer.HistogramBin
• setCrowdingEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setCurrentTimestep() : sortie.datavisualizer.DataRequest
• setCursorToDefault() : sortie.gui.MainWindow
• setCutAmountType() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setCutType() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setDamageEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setDataMembers() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setDebug() : sortie.fileops.TarArchive
• setDensity() : sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData
• setDescriptor() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.data.simpletypes.ModelData
• setDetailedOutputFileName() : sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput
• setDetailedSubplotXCellLength() : sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput
• setDetailedSubplotYCellLength() : sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput
• setDisplayName() : sortie.data.simpletypes.DataMember
• setEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setGridBoolCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridCharCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridFloatCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridIntCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridName() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridPackageBoolCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridPackageCharCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridPackageFloatCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridPackageIntCode() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridPackageValue() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setGridValue() : sortie.data.funcgroups.Grid
• setInfectionEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setInitialDensities() : sortie.data.funcgroups.TreeBehavior
• setInitialSeedlingSize() : sortie.data.funcgroups.TreeBehavior
• setIsSpeciesSpecific() : sortie.data.simpletypes.ModelVector
• setKeepOldFiles() : sortie.fileops.TarArchive
• setKneeColor() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setKneeDisplayColor() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setKneeDisplayValue() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setKneeValue() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setLastTouched() : sortie.gui.behaviorsetup.AllometryFunctionEditor , sortie.gui.behaviorsetup.AllometryParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.ClimateImporterEditor , sortie.gui.behaviorsetup.DefaultBehaviorParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.EnhancedTable , sortie.gui.behaviorsetup.EnhancedTableWindow , sortie.gui.behaviorsetup.NCIParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.StormParameterEdit , sortie.gui.GridValueEditor
• setLatitude() : sortie.data.funcgroups.Plot
• setListPosition() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.data.funcgroups.light.GLIMap
• setMaximumColor() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setMaximumDisplayColor() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setMaximumDisplayValue() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setMaximumValue() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setMinimumAdultDbh() : sortie.data.funcgroups.TreeBehavior
• setMinimumColor() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setMinimumCrownRadius() : sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest
• setMinimumDbh() : sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest
• setMinimumDisplayColor() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setMinimumDisplayValue() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setMinimumValue() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setMinZ() : sortie.datavisualizer.XYTreeRenderer
• setModelState() : sortie.gui.MainWindow
• setNCITerm() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setNitrogenEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setNumberOfTimesteps() : sortie.data.funcgroups.Plot , sortie.datavisualizer.DetailedOutputLegend
• setNumberOfYearsPerTimestep() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• setParFileTimesteps() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• setPlantSpacing() : sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData
• setPlotTitle() : sortie.data.funcgroups.Plot
• setPlotXLength() : sortie.data.funcgroups.Plot
• setPlotYLength() : sortie.data.funcgroups.Plot
• setPptData() : sortie.data.funcgroups.statechange.ClimateImporter
• setPrecipitationEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setPrioritiesInfo() : sortie.gui.harvepplant.HarvestEdit
• setPriority1() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setPriority2() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setPriority3() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setRandomSeed() : sortie.data.funcgroups.Plot
• setSaveAbsoluteBasalArea() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setSaveAbsoluteDensity() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setSaveFrequency() : sortie.data.simpletypes.DetailedOutputSettings
• setSaveRelativeBasalArea() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setSaveRelativeDensity() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setScaleFactor() : sortie.datavisualizer.XYTreeRenderer
• setSeedlingMortRate() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setSelectedAllDead() : sortie.gui.ShortOutputFileSetup
• setSelectedAllLive() : sortie.gui.ShortOutputFileSetup
• setSeriesKneePaint() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setSeriesMinPaint() : sortie.datavisualizer.XYCellRenderer
• setShadingEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setShortOutputFileName() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setShortSubplotXCellLength() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setShortSubplotYCellLength() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• setSingleValue() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.data.funcgroups.substrate.DetailedSubstrate , sortie.data.funcgroups.substrate.Substrate
• setSingleValueByXMLTag() : sortie.data.funcgroups.analysis.ConditOmegaCalculator , sortie.data.funcgroups.analysis.RipleysKCalculator , sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.data.funcgroups.disturbance.EpisodicMortality , sortie.data.funcgroups.disturbance.Harvest , sortie.data.funcgroups.disturbance.SelectionHarvest , sortie.data.funcgroups.management.QualityVigorClassifier , sortie.data.funcgroups.nci.NCILargerNeighbors , sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase , sortie.data.funcgroups.nci.NCINeighborBA , sortie.data.funcgroups.nci.NCITermDefault , sortie.data.funcgroups.nci.NCITermWithNeighborDamage , sortie.data.funcgroups.nci.NCIWithSeedlings , sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput , sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput , sortie.data.funcgroups.planting.Planting , sortie.data.funcgroups.TreeBehavior , sortie.tools.parfileupdater.DisturbanceBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.EstablishmentBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.GroupBase , sortie.tools.parfileupdater.GrowthBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.LightBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.MortalityBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.PlantingBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.SeedPredationBehaviors
• setSizeClasses() : sortie.data.funcgroups.TreeBehavior
• setSizeEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setSpacingDistance() : sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData
• setSpecies() : sortie.data.simpletypes.DetailedTreeSettings , sortie.data.simpletypes.SpeciesTypeCombo
• setSpeciesInfo() : sortie.gui.harvepplant.HarvestEdit
• setSpeciesNames() : sortie.data.funcgroups.TreePopulation
• setSubplotXCellLength() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• setSubplotYCellLength() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• setTallestFirstFlag() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• setTarProgressDisplay() : sortie.fileops.TarArchive
• setTempData() : sortie.data.funcgroups.statechange.ClimateImporter
• setTempDirectory() : sortie.fileops.TarArchive
• setTemperatureEffect() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setTimestep() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData , sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData
• setTransFileTyper() : sortie.fileops.TarArchive
• setType() : sortie.data.simpletypes.DataMember
• setUpCharting() : sortie.gui.harvepplant.DisplayWindowBase , sortie.gui.harvepplant.EditWindowBase , sortie.gui.SubplotEdit
• setUpCheckboxes() : sortie.gui.ShortOutputFileSetup
• setupDataset() : sortie.datavisualizer.RelativeNeighborhoodDensityDataRequest , sortie.datavisualizer.RipleysKDataRequest
• setupEnums() : sortie.data.funcgroups.disperse.MastingSpatialDisperse
• setupLikeOldBANCI() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setupLikeOldNCI() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setupLikeOldNCIJuvenile() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setupLikeOldWeibullClimate() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setupLikeOldWeibullClimateQuadrat() : sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• setUserInfo() : sortie.fileops.TarArchive
• setUserSetDisplay() : sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• setValue() : sortie.data.simpletypes.DataMemberData , sortie.data.simpletypes.ModelEnum , sortie.data.simpletypes.ModelFloat , sortie.data.simpletypes.ModelInt , sortie.data.simpletypes.ModelString , sortie.parfile.SwingWorker
• setVectorValueByXMLTag() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.data.funcgroups.disturbance.EpisodicMortality , sortie.data.funcgroups.disturbance.Harvest , sortie.data.funcgroups.management.QualityVigorClassifier , sortie.data.funcgroups.nci.CrowdingEffectDefault , sortie.data.funcgroups.nci.CrowdingEffectNoSize , sortie.data.funcgroups.nci.DamageEffectDefault , sortie.data.funcgroups.nci.NCILargerNeighbors , sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase , sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterGrowth , sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterMortality , sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterQuadratGrowth , sortie.data.funcgroups.nci.NCINeighborBA , sortie.data.funcgroups.nci.NCITermDefault , sortie.data.funcgroups.nci.NCITermWithNeighborDamage , sortie.data.funcgroups.nci.NCIWithSeedlings , sortie.data.funcgroups.nci.PrecipitationEffectWeibull , sortie.data.funcgroups.nci.ShadingDefault , sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectDefault , sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectLowerBounded , sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectPowerFunction , sortie.data.funcgroups.nci.TemperatureEffectWeibull , sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput , sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput , sortie.data.funcgroups.planting.Planting , sortie.data.funcgroups.statechange.ClimateImporter , sortie.data.funcgroups.TreeBehavior
• setVectorValues() : sortie.data.funcgroups.Behavior
• setVerbose() : sortie.fileops.TarArchive
• setWhatAdultCDHFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setWhatAdultCRDFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setWhatAdultHDFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setWhatSaplingCDHFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setWhatSaplingCRDFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setWhatSaplingHDFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setWhatSeedlingHDFunction() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• setXCellLength() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData , sortie.data.funcgroups.Grid , sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData , sortie.data.simpletypes.DetailedGridSettings , sortie.datavisualizer.XYCellRenderer , sortie.datavisualizer.XYSimpleCellRenderer
• setXMLTag() : sortie.data.simpletypes.ModelData
• setXPlotLength() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• setYCellLength() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData , sortie.data.funcgroups.Grid , sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData , sortie.data.simpletypes.DetailedGridSettings , sortie.datavisualizer.XYCellRenderer , sortie.datavisualizer.XYSimpleCellRenderer
• setYearsPerTimestep() : sortie.data.funcgroups.Plot
• setYPlotLength() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• setYValue() : sortie.datavisualizer.ModelHistogramDataset
• ShadedLinearGrowth() : sortie.data.funcgroups.growth.ShadedLinearGrowth
• ShadedLinearGrowthHeightOnly() : sortie.data.funcgroups.growth.ShadedLinearGrowthHeightOnly
• ShadingDefault() : sortie.data.funcgroups.nci.ShadingDefault
• ShortOutput() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• ShortOutputFileManager() : sortie.datavisualizer.ShortOutputFileManager
• ShortOutputFileSetup() : sortie.gui.ShortOutputFileSetup
• showError() : sortie.gui.ErrorGUI
• SimpleLinear() : sortie.data.funcgroups.growth.SimpleLinear
• SimpleLinearHeightOnly() : sortie.data.funcgroups.growth.SimpleLinearHeightOnly
• sizeChildWindow() : sortie.gui.harvepplant.DisplayWindowBase
• SizeClassEditor() : sortie.gui.SizeClassEditor
• SizeDependentLogisticMortality() : sortie.data.funcgroups.mortality.SizeDependentLogisticMortality
• SizeDepLogistic() : sortie.data.funcgroups.growth.SizeDepLogistic
• SizeDepLogisticHeightOnly() : sortie.data.funcgroups.growth.SizeDepLogisticHeightOnly
• SizeEffectCompoundExpInf() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectCompoundExpInf
• SizeEffectCompoundExponential() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectCompoundExponential
• SizeEffectDefault() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectDefault
• SizeEffectLowerBounded() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectLowerBounded
• SizeEffectPowerFunction() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectPowerFunction
• SizeEffectShiftedLogInf() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectShiftedLogInf
• SizeEffectShiftedLognormal() : sortie.data.funcgroups.nci.SizeEffectShiftedLognormal
• skipLine() : sortie.fileops.ModelFileFunctions
• sleep() : sortie.parfile.SwingWorker.ThreadVar
• SnagDecayClassDynamics() : sortie.data.funcgroups.snagdynamics.SnagDecayClassDynamics
• SnagDynamicsBehaviors() : sortie.data.funcgroups.SnagDynamicsBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.SnagDynamicsBehaviors
• sortBehaviors() : sortie.data.funcgroups.BehaviorTypeBase
• SORTIEComboBox() : sortie.gui.components.SORTIEComboBox< T >
• SortieFont() : sortie.gui.components.SortieFont
• SortieLabel() : sortie.gui.components.SortieLabel
• SortieMenuItem() : sortie.gui.components.SortieMenuItem
• SpatialDisperseBase() : sortie.data.funcgroups.disperse.SpatialDisperseBase
• SpeciesTypeCombo() : sortie.data.simpletypes.SpeciesTypeCombo
• StandTableDataRequest() : sortie.datavisualizer.StandTableDataRequest
• start() : sortie.parfile.SwingWorker
• startElement() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileSetupParseHandler , sortie.datavisualizer.DetailedOutputTimestepParseHandler , sortie.sax.ParameterFileParser , sortie.tools.parfileupdater.OldParFileParser
• StateChangeBehaviors() : sortie.data.funcgroups.StateChangeBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.StateChangeBehaviors
• StateReporter() : sortie.data.funcgroups.analysis.StateReporter
• StateVariableTableDataRequest() : sortie.datavisualizer.StateVariableTableDataRequest
• step() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputLegend
• StochasticBiLevelLightMortality() : sortie.data.funcgroups.mortality.StochasticBiLevelLightMortality
• StochasticGap() : sortie.data.funcgroups.growth.StochasticGap
• StochasticMort() : sortie.data.funcgroups.mortality.StochasticMort
• StochDoubleLogTempDepNeighDisperse() : sortie.data.funcgroups.disperse.StochDoubleLogTempDepNeighDisperse
• StockTableDataRequest() : sortie.datavisualizer.StockTableDataRequest
• stop() : sortie.parfile.Interface
• Storm() : sortie.data.funcgroups.disturbance.Storm
• StormDamageApplier() : sortie.data.funcgroups.disturbance.StormDamageApplier
• StormDamageKiller() : sortie.data.funcgroups.disturbance.StormDamageKiller
• StormDataRequest() : sortie.datavisualizer.StormDataRequest
• StormDirectKiller() : sortie.data.funcgroups.disturbance.StormDirectKiller
• StormKilledPartitionedBiomassDataRequest() : sortie.datavisualizer.StormKilledPartitionedBiomassDataRequest
• StormKilledPartitionedDBHBiomass() : sortie.data.funcgroups.analysis.StormKilledPartitionedDBHBiomass
• StormKilledPartitionedHeightBiomass() : sortie.data.funcgroups.analysis.StormKilledPartitionedHeightBiomass
• StormLight() : sortie.data.funcgroups.light.StormLight
• StormLightDependentSeedSurvival() : sortie.data.funcgroups.establishment.StormLightDependentSeedSurvival
• StormParameterEdit() : sortie.gui.behaviorsetup.StormParameterEdit
• Subplot() : sortie.data.funcgroups.Subplot
• SubplotEdit() : sortie.gui.SubplotEdit
• Substrate() : sortie.data.funcgroups.substrate.Substrate
• SubstrateBehaviors() : sortie.data.funcgroups.SubstrateBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.SubstrateBehaviors
• SubstrateDepEstablishmentBase() : sortie.data.funcgroups.establishment.SubstrateDepEstablishmentBase
• SubstrateLineGraphDataRequest() : sortie.datavisualizer.SubstrateLineGraphDataRequest
• SuppressionDurationMort() : sortie.data.funcgroups.mortality.SuppressionDurationMort
• SwingWorker() : sortie.parfile.SwingWorker