- a -

• AbsoluteGrowthBALimited() : sortie.data.funcgroups.growth.AbsoluteGrowthBALimited
• AbsoluteGrowthRadialLimited() : sortie.data.funcgroups.growth.AbsoluteGrowthRadialLimited
• AbsoluteUnlimited() : sortie.data.funcgroups.growth.AbsoluteUnlimited
• accept() : sortie.gui.components.FileOpenFilter , sortie.gui.components.OutFileFilter , sortie.gui.components.OutputFileFilter , sortie.gui.components.TextFileFilter , sortie.gui.components.XMLFileFilter , sortie.gui.DetailedOutputFileFilter
• actionPerformed() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DesktopListener , sortie.datavisualizer.DetailedOutputLegend , sortie.datavisualizer.FoliarChemistryLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.GridAllSpeciesHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.GridHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.Legend , sortie.datavisualizer.LineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.NoSpeciesLegend , sortie.datavisualizer.PartitionedBiomassLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.StandTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StockTableDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter , sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest , sortie.gui.BatchSetup , sortie.gui.behaviorsetup.AllometryFunctionEditor , sortie.gui.behaviorsetup.AllometryParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.ClimateImporterEditor , sortie.gui.behaviorsetup.DefaultBehaviorParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.EnhancedTable , sortie.gui.behaviorsetup.HarvestInterfaceSetup , sortie.gui.behaviorsetup.HarvestInterfaceSetup.FileColumnsChooser , sortie.gui.behaviorsetup.NCIEffectsEditor , sortie.gui.behaviorsetup.NCIParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.ParameterEdit , sortie.gui.behaviorsetup.StormParameterEdit , sortie.gui.DetailedOutputDeadTreeSetup , sortie.gui.DetailedOutputFileCopy , sortie.gui.DetailedOutputFileSetup , sortie.gui.DetailedOutputGridSetup , sortie.gui.DetailedOutputTreeSetup , sortie.gui.GridCellEditor , sortie.gui.GridSetup , sortie.gui.GridValueEditor , sortie.gui.harvepplant.Diam10Edit , sortie.gui.harvepplant.DisplayWindowBase , sortie.gui.harvepplant.EditWindowBase , sortie.gui.harvepplant.HarvestDisplayWindow , sortie.gui.harvepplant.HarvestEdit , sortie.gui.harvepplant.MortalityEpisodeDisplayWindow , sortie.gui.harvepplant.MortalityEpisodeEdit , sortie.gui.harvepplant.PlantEdit , sortie.gui.harvepplant.PlantingDisplayWindow , sortie.gui.MainWindow , sortie.gui.ManageTreeMap , sortie.gui.modelflowsetup.DisplayBehaviorComboEdit , sortie.gui.modelflowsetup.DisplayBehaviorEdit , sortie.gui.modelflowsetup.DisplayComboEdit , sortie.gui.modelflowsetup.ModelFlowSetup , sortie.gui.OutputSetup , sortie.gui.ScheduledStormSetup , sortie.gui.ShortOutputFileSetup , sortie.gui.SizeClassEditor , sortie.gui.SubplotEdit , sortie.gui.TreeSpeciesSetup , sortie.gui.TreeSpeciesSetup.CopySpeciesEditor , sortie.tools.batchoutput.BatchOptionsDialog , sortie.tools.batchoutput.FileChoosingWindow , sortie.tools.batchoutput.OptionChoosingWindow , sortie.tools.batchoutput.ProgressDialog
• addAbundance() : sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData
• addBatchData() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addBool() : sortie.data.simpletypes.DetailedOutputSettings
• addButtonActionPerformed() : sortie.gui.DetailedOutputDeadTreeSetup , sortie.gui.DetailedOutputTreeSetup
• addCell() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData , sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData , sortie.data.funcgroups.Subplot
• addChar() : sortie.data.simpletypes.DetailedOutputSettings
• addChartForBatchExtraction() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addClass() : sortie.gui.SizeClassEditor
• addCurrentRunFile() : sortie.datavisualizer.DataVisualizerManager
• addCutRange() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData
• addDataMember() : sortie.gui.behaviorsetup.HarvestInterfaceSetup
• addDataObjectToDisplayArrays() : sortie.data.funcgroups.Behavior
• addDataToArray() : sortie.data.funcgroups.Behavior
• addDataToFileRow() : sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addDeadTreeBoolData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addDeadTreeCharData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addDeadTreeFloatData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.LineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter , sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest
• addDeadTreeIntData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addDefaultsToMainPanel() : sortie.gui.behaviorsetup.ClimateImporterEditor
• addDetailedGridSettings() : sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput
• addDetailedOutputSubplot() : sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput
• addDetailedTreeSettings() : sortie.data.funcgroups.output.DetailedOutput
• addFile() : sortie.datavisualizer.DataVisualizerManager , sortie.gui.BatchSetup
• addFileMenu() : sortie.datavisualizer.DataGrapher
• addFiles() : sortie.tools.batchoutput.FileChoosingWindow
• addFinishedData() : sortie.gui.harvepplant.DisplayWindowBase , sortie.gui.harvepplant.HarvestDisplayWindow , sortie.gui.harvepplant.MortalityEpisodeDisplayWindow , sortie.gui.harvepplant.PlantingDisplayWindow
• addFloat() : sortie.data.simpletypes.DetailedOutputSettings
• addGLIPointsFile() : sortie.data.funcgroups.light.GLIPoints
• addGrid() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.gui.GUIManager
• addGridBoolData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• addGridBoolDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.GridDataRequest
• addGridCharData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridCharDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridFloatData() : sortie.datavisualizer.CarbonValueDataRequest , sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.FoliarChemistryLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.FoliarChemistryTableDataRequest , sortie.datavisualizer.GridAllSpeciesHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.GridDataRequest , sortie.datavisualizer.GridHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.HarvestDataRequest , sortie.datavisualizer.MerchValueDataRequest , sortie.datavisualizer.PartitionedBiomassLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.PartitionedBiomassTableDataRequest , sortie.datavisualizer.RelativeNeighborhoodDensityDataRequest , sortie.datavisualizer.RipleysKDataRequest , sortie.datavisualizer.SeedTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StateVariableTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StormKilledPartitionedBiomassDataRequest , sortie.datavisualizer.SubstrateLineGraphDataRequest
• addGridFloatDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.CarbonValueDataRequest , sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.FoliarChemistryLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.FoliarChemistryTableDataRequest , sortie.datavisualizer.GridAllSpeciesHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.GridDataRequest , sortie.datavisualizer.GridHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.HarvestDataRequest , sortie.datavisualizer.MerchValueDataRequest , sortie.datavisualizer.PartitionedBiomassLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.PartitionedBiomassTableDataRequest , sortie.datavisualizer.RelativeNeighborhoodDensityDataRequest , sortie.datavisualizer.RipleysKDataRequest , sortie.datavisualizer.SeedTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StateVariableTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StormKilledPartitionedBiomassDataRequest , sortie.datavisualizer.SubstrateLineGraphDataRequest
• addGridIntData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.GridAllSpeciesHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.GridDataRequest , sortie.datavisualizer.GridHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.HarvestDataRequest
• addGridIntDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.GridAllSpeciesHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.GridDataRequest , sortie.datavisualizer.GridHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.HarvestDataRequest
• addGridPackageBoolData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridPackageBoolDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridPackageCharData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridPackageCharDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridPackageFloatData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.StormDataRequest , sortie.datavisualizer.WindstormDataRequest
• addGridPackageFloatDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.StormDataRequest , sortie.datavisualizer.WindstormDataRequest
• addGridPackageIntData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridPackageIntDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridXCellLength() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addGridYCellLength() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addHarvestData() : sortie.data.funcgroups.disturbance.Harvest
• addHarvestEvent() : sortie.data.funcgroups.disturbance.Harvest
• addInt() : sortie.data.simpletypes.DetailedOutputSettings
• addMonthlyDataToMainPanel() : sortie.gui.behaviorsetup.ClimateImporterEditor
• addMortalityEpisode() : sortie.data.funcgroups.disturbance.EpisodicMortality
• addNewEpisode() : sortie.gui.harvepplant.MortalityEpisodeEdit
• addNewHarvest() : sortie.gui.harvepplant.HarvestEdit
• addNewPlanting() : sortie.gui.harvepplant.PlantEdit
• addNewTreeDataMember() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestInterface
• addPackageBool() : sortie.data.simpletypes.DetailedGridSettings
• addPackageChar() : sortie.data.simpletypes.DetailedGridSettings
• addPackageFloat() : sortie.data.simpletypes.DetailedGridSettings
• addPackageInt() : sortie.data.simpletypes.DetailedGridSettings
• addParFile() : sortie.gui.BatchSetup
• addPlantingData() : sortie.data.funcgroups.planting.Planting
• addPlantingEvent() : sortie.data.funcgroups.planting.Planting
• addRequiredData() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.tools.parfileupdater.Behavior
• addSeries() : sortie.datavisualizer.ModelHistogramDataset
• addSeriesToDataset() : sortie.datavisualizer.GridAllSpeciesHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.GridHistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest
• addShortOutputSubplot() : sortie.data.funcgroups.output.ShortOutput
• addSpecies() : sortie.data.funcgroups.disturbance.HarvestData , sortie.data.funcgroups.planting.PlantingData , sortie.gui.TreeSpeciesSetup
• addSpeciesName() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addSpeciesTypeCombo() : sortie.data.funcgroups.Behavior , sortie.data.funcgroups.nci.NCIMasterBase
• addStorm() : sortie.gui.ScheduledStormSetup
• addStormEvent() : sortie.data.funcgroups.disturbance.Storm
• addSubplotCell() : sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager
• addTabDelimTreeMapFile() : sortie.data.funcgroups.TreePopulation
• addTotalSeries() : sortie.datavisualizer.ModelHistogramDataset
• addTreeBoolData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addTreeBoolDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addTreeCharData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addTreeCharDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addTreeFloatData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.LineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.OverviewTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StandTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StockTableDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter , sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest
• addTreeFloatDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.LineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.OverviewTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StandTableDataRequest , sortie.datavisualizer.StockTableDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter , sortie.datavisualizer.TreeMapCrownRadDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeMapDataRequest
• addTreeIntData() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• addTreeIntDataMemberCode() : sortie.datavisualizer.DataRequest , sortie.datavisualizer.DetailedOutputFileManager , sortie.datavisualizer.HistogramDataRequest , sortie.datavisualizer.TreeListWriter
• adjustVisible() : sortie.datavisualizer.SubstrateLineGraphDataRequest
• adjustVisibleSpecies() : sortie.datavisualizer.FoliarChemistryLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.LineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.PartitionedBiomassLineGraphDataRequest , sortie.datavisualizer.ShortOutputFileManager
• AggregatedMortality() : sortie.data.funcgroups.mortality.AggregatedMortality
• AllometricDiam() : sortie.data.funcgroups.growth.AllometricDiam
• AllometricHeight() : sortie.data.funcgroups.growth.AllometricHeight
• Allometry() : sortie.data.funcgroups.Allometry
• AllometryFunctionEditor() : sortie.gui.behaviorsetup.AllometryFunctionEditor
• AllometryParameterEdit() : sortie.gui.behaviorsetup.AllometryParameterEdit
• AnalysisBehaviors() : sortie.data.funcgroups.AnalysisBehaviors , sortie.tools.parfileupdater.AnalysisBehaviors
• anyBehaviorsEnabled() : sortie.data.funcgroups.BehaviorTypeBase
• areCurrentRunChartsOpen() : sortie.datavisualizer.DataVisualizerManager
• assignData() : sortie.gui.modelflowsetup.ModelFlowSetup
• AverageLight() : sortie.data.funcgroups.light.AverageLight